对环境水进行PCR检测的主要挑战之一是游离DNA的潜在存在，这可能导致对目标DNA序列水平的过高估计。

当量化军团菌，培养和PCR水平之间的差异可达2个log。以提高信心为结果军团菌为了补充完整的培养和qPCR溶液，Bio-Rad引入了一种新的简单快速的溶液，使用iQ-Check Free DNA Removal solution (FDRS)，可以很容易地集成到Aquadien DNA提取协议中。FDRS(目录#3594970)提供了一种理想和安全的方法，可以在PCR分析前从水样中去除游离DNA，而不需要使用有害化学物质。

当完整细胞和活细胞中的DNA受到保护时，FDRS会降解样本中死亡和裂解细胞中的游离DNA。使用Aquadien Free DNA Removal Solution协议，可以在不作用于活细胞的情况下，将来自游离DNA的信号减少到2.5对数。

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