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如何用人工智能自动微生物学

冠状病毒(SARS-COV-2)Covid-19的快速抗原/近乎患者/ POC测试 - 买方指南

快速抗原试验方法

关键点:

  • 快速,使用唾液或拭子样品的SARS-COV-2抗原的护理时间点现在广泛可用
  • 这些POC测试比黄金标准RT-PCR敏感,但具有高特异性
  • 易于使用和解释,导致时间可以在10分钟至40分钟之间,具体取决于测定的类型
  • 等温扩增可以与其他检测方法相结合,即CIRSPR,提高准确性。
  • 套件制造商性能声明通常是从可能不代表现实样本的高病毒载样本产生的。

COVID-19抗原检测试剂盒用于筛查

抗原检测试剂盒在市场靶标SARS-COV-2蛋白抗原,主要是核蛋白(NP)抗原。有几种不同类型的抗原检测套件:

  • 化学发光免疫测定(CLIA)
  • 荧光(FIA)免疫测定
  • 侧向流动免疫测定(LFIA)
  • 横向流动荧光免疫测定

介绍:世界卫生组织(世卫组织)宣布,只有在RT-PCR不可用的情况下,才能使用快速抗原检测试验(RADTS),并且它们必须具有≥90%的灵敏度和99%的特异性。这种预防方法是在许多关于具有第一代Covid-19 Radrs的假阴性的报告之后。

还有关于Radrs的误报的报道,最有可能由于嵌入的抗体与循环中的其他冠状病毒交叉反应。这些假阳性主要与靶向N-蛋白(核衣壳蛋白)的试验相关;在其他人冠状病毒中具有高度保守的抗原。

然而,尖峰蛋白(许多Covid-19疫苗中的组分)仅在SARS-COV-2中具有高度保守的亚基(S1)。靶向该蛋白质的任何抗原测试不太可能产生误报。有变体的问题,其中突变发生在穗蛋白中,这具有潜力使这些测试无效。如果测试已为每个变体验证,测试实验室应检查制造商。

有几种radt可以在唾液样本中检测SARS-CoV-2,这是一个首选,因为它对患者更友好,但它们的准确性可能有所不同。

自动化测试读取器可以提高大多数RADRS的灵敏度。他们还可以在数字录制测试结果,促进国际旅行,并向公共卫生机构向监视目的发送报告。

免疫层状/侧流免疫测定(LFIA):

这是基于常见的妊娠测试设计的。该测试包括特殊的涂层抗体与阴性和阳性对照固定在其条上。必须在指定的时间点查看测试以读取正确的结果。

也有商业化的自动读取设备,诊断条被插入其中,从而避免人为错误。这些阅读者在验证研究中比视觉阅读表现得更好。这些读者可以给出半定量或定量的结果。这些测试可以由不熟练的操作人员在接近病人的环境中进行,周转时间通常为15分钟。这使它们成为理想的港口,但只有在旅客人数减少的情况下,因为没有检测到患者体内的低病毒载量,有可能出现假阴性结果。

COVID-19核酸/分子近患者检测/护理点检测:

等温扩增:

Covid-19使用等温核酸扩增技术的测试广泛可用,比横向流动测试更准确。由于其在Zika病毒流行期间,环介导的等温扩增(灯)是该分子工具最着名的版本。灯测试不需要热循环仪,并且只需要一个简单的散热块来提供恒定温度(范围(60-65℃),以激活其两种酶,用于将RNA转换为DNA,另一种复制DNA。一套of primers is also added to bind to the targets on the viral genome. 'Loop' structures are formed that allow rapid interpretation for a result (i.e.changes in turbidity, color or fluorescence). This method has a low limit of detection (LoD), but studies have shown it to be less accurate than RT-PCR.

该技术的其他变化包括切口酶辅助反应(接近),重组酶聚合酶扩增(RPA)和绝缘等温聚合酶链反应(RT-IIPCR)。

CRISPR和等温扩增:

使用等温放大方法在市场上有几种CRISPR SARS-COV-2测试。专有的分子工具如Sherlock和Dexectrobe,其与CRISPR CAS 12/13进行检测的序列和分子系统已经证明了PCR的结果类似的结果。

测序和等温扩增:

等温放大技术的一个问题是,样品中存在的物质可能会影响测试的读数,即浊度。使用纳米测序来读取结果可以增加敏感性和特异性。这个测试的一个例子是牛津大学开发的LAMPORE分析。

快速PCR

目前已有几种快速PCR检测方法(FDA-EUA和CE-IVD),它们是为近患者环境设计的一些已经在机场使用这些PCR循环患者具有小的占地面积,通常称重1KG,它们分析棉签样品并自动化核酸提取和扩增,只有操作所需的基本技能。结果的平均周转时间为40分钟。

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