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SARS-CoV-2:废水中的COVID-19监测

快速试验废水COVID-19监视

重点:

  • SARS-CoV-2通过粪便排入废水,然后利用qPCR和NGS平台进行检测
  • SARS-CoV的-2废水中的监控允许非侵入性的局部块的筛选
  • 采样应在高峰时段,即早上和傍晚进行
  • 建议使用人类粪便指标对SARS-CoV-2浓度进行标准化
  • 快速现场/现场测试方法只需要很少的培训,节省时2021欧洲杯德国vs意大利竞猜间和金钱,并且对于局部/目标和高风险地区的监测非常有用,例如,养老院、医院、工作场所等。

作品简介:

SARS-CoV的-2,使COVID-19,穿过人体进入粪便(屎),并在废水处理厂(WWTP)的污水结束病毒。将样品从流入/原污水采取在污水处理厂,浓缩,并且将所提取的RNA然后SARS-CoV的-2 RNA的存在进行测试。这让卫生部门来获取他们可以与临床试验结果进行相关性SARS-COV-2监测数据。此外,该数据有利于:

  • 对SARS-CoV-2临床检测准确性的补充分析
  • 疫苗接种效果跟踪
  • 疫苗接种运动的区域目标
  • 一个主动的测试策略,即,可以显示为另一波的早期预警信号
  • 检测新出现的变种

世界各地的国家和地区的卫生部门正在执行SARS-COV-2的废水中的监视。大多数这些样品都是从污水处理厂进水采取国家当局所建议。(点击这里美国疾病预防控制中心国家污水综合监控系统或点击这里欧盟推荐)

对于诸如疗养院和医院等高风险地区的监测,或者对于工作场所和大学校园/宿舍等有针对性/本地化的活动,快速检测方法在提供实时、高质量数据方面非常有效。2021欧洲杯德国vs意大利竞猜这些移动检测提供了一个完整的工具包(公文包大小)——从浓度到金标准的qPCR结果,只需最低限度的个人培训就能完成,不需要生物安全实验室。

采样废水用于SARS-CoV-2/COVID-19

采取将取决于所使用的浓度/提取方法的样品,具有典型的样本大小的尺寸可以从大到6L向下至1ml。一次性“抢”样品可从废水中通过使用袋介导的过滤系统(生物放大系数),例如,其中一个6L袋用于舀出的水的样品被收集,然后被放置在三脚架上,以允许重力将通过过滤使样品,收集任何病毒颗粒存在。

自动“复合”采样可以收集废水等份周期性在24小时的时间内,得到一个更好的表示。在对SARS-COV-2和它的变种,发表在2021年三月的监控欧盟建议,欧盟委员会向成员国,为了保证结果的可靠性和可比性,复合采样应在24小时内使用。“被动采样”涉及装置在水体的部署的时间周期已知,并可以做到使用廉价的材料,如吸附剂拭子/医用纱布等


SARS-COV-2浓度和废水提取方法

快速,有效(高回收率),和具有成本效益的病毒浓缩方法,需要监测SARS-CoV的-2和其核酸未处理废水样品用于水性流行病学为COVID-19监视的成功应用英寸浓缩废水样品可以提高SARS-CoV的-2 RNA的检测,并且存在产生对SARS-CoV的-2检测的废水中回收足够的几种不同的方法。这些包括:

  • 超滤-这涉及高速离心。
  • 通过电负性膜过滤,并通过添加MgCl2或酸化对样品进行预处理——该方法目前正在日本用于国家脊髓灰质炎病毒监测。这个方法需要很多步骤
  • 聚乙二醇(PEG)沉淀法-从水基质中浓缩病毒的常用方法
  • 脱脂乳絮凝
  • 超速离心法

如果时间和成本是限制因素,还可以跳过这些步骤,直接进行提取。例如,利用磁结合珠技术,可以从固体和液体中提取SARS-CoV-2,这意味着使用的SARS-CoV-2分子检测测试将在水和固体中寻找病毒RNA。由于固体中的SARS-CoV-2比液体中的更多,对两种类型的样本进行病毒RNA检测的方法将提高结果的准确性。在常规微生物检测实验室中使用磁珠提取核酸,由于其易于自动化和提取的RNA的高质量和数量,已成为一种流行的方法。由于不需要额外的耗时浓缩步骤,这种提取技术已被快速/现场/现场移动测试套件的制造商所采用。

核酸(RNA)提取方法:
硅胶柱,磁珠,沉淀。

人类排泄物的指标:
Human fecal indicators are used to normalize the concentration of SARS-CoV-2 in wastewater, i.e., to know for sure that an increase in recovered SARS-CoV-2 RNA is from the increased transmission and not from a rise in population numbers e.g.vacation. These indicators can be organisms, viruses, or enzymes specific to human feces. Some examples currently in use are the pepper mild mottle virus (PPMV), crAssphage (a bacteriophage found in high-quantities in the human gut), RNASP, and cytochrome B.

废水中SAR2021欧洲杯德国vs意大利竞猜S-CoV-2现场/现场检测的快速测试方法/流动实验室

针对SARS2021欧洲杯德国vs意大利竞猜冠状病毒-2的废水监控快速测试方法易于使用,并且需要为在现场/现场技术人员无需特别培训/资格。通过减少通常所需的废水测试步骤的数量,移动试剂盒可以具有从样品SARS-CoV的-2 RNA的一个更好的恢复,保持的时间缩短了,因此提供了更快的高质量结果。这些移动试剂盒除去费力的预浓缩步骤之前提到的,如PEG或电负性膜过滤,通过使用较小的样本和磁珠结合技术。它们还包括一个黄金标准qPCR仪器并能同时允许任何地方运行多达15个样品。

这俩美国疾病预防控制中心世卫组织说几乎没有证据表明水中存在传染性SARS-CoV-2病毒。然而,操作人员应使用标准操作规程,实施基本卫生预防措施,并在操作测试套件时佩戴个人防护装备。这些快速试剂盒包括灭活病毒的试剂和清洗珠子上可能抑制PCR反应的杂质的溶液。这些试剂盒的分子目标是基因组的保守区域,通常在突变事件中不会发生改变。雷电游戏app为了检测新的和正在出现的变异,这些试剂盒供应商向客户提供远程测试服务,样品可以送到他们的实验室进行测序。

SARS-COV-2检测从废水样品:

据疾病控制和预防在美国和欧洲,引物的中心和探头针对SARS-COV-2 N(N1和N2,美国疾病预防控制中心)和E基因(ECDC)的区域是敏感和具体量化非典(SARS)COV-2 RNA的废水英寸

RT-qPCR的:这是SARS-CoV-2检测的黄金标准。然而,如果该分析只用于检测s基因,那么如果样本中存在变异,它可能会给出假阴性结果。因此,建议使用有两个目标的测试,以尽量减少任何假阴性。使用多重qPCR检测,可以确定样品中每个变体的水平。

数字滴PCR(ddPCR):这是一种非常精确的测试,可以给出确切的病毒拷贝数。1步RT- ddpcr方案对废水是有利的,因为RT是在单个液滴中进行的,相比于在散装溶液中进行的RT,这可以减少RT的抑制作用,就像在两步过程和RT- qpcr中一样。(来源:中华网

NGS:结果可能很难解释,如果有目前流传在社会上几个感染。但是,测序是目前唯一可识别的新变种的唯一方法。废水的测序是揭示有价值的信息,而不仅仅是对SARS-COV-2,还包括其他流行的病毒和病原体和一般的人类微生物。

最新消息

废水中SARS-CoV-2快速监测方法发布时间:2021年8月23日 用于监测全社区SARS-COV-2感染率利用废水样品完整的工作流程发布时间:2021年8月18日 持续大流行需要完整的SARS-CoV-2检测解决方案发布时间:2021年8月6日 查看全部

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Bioperfectus COVID-19快速检测系列,讨巧Lockdowns的: SARS-CoV-2变异株实时RT-PCR鉴定试剂盒 Bioperfectus新型冠状病毒(SARS-COV-2)的Ag快速检测试剂盒 查看全部


供应商信息

+现场测试方法(一2021欧洲杯德国vs意大利竞猜体化方案)1产品发现

+从废水SARS-COV-2的浓度4个产品发现

+SARS-COV-2检测的废水3产品发现

+SARS-COV-2和变体废水测试服务发现2个产品

+能力测试为SARS-COV-2检测的废水1产品发现



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