据世卫组织称，目前占主导地位的德尔塔变种是“所有SARS-CoV-2毒株中最健康和最快的”，也是最近被他们列为关注变种(VOC)的一种。虽然COVID-19疫苗已被证明是我们抗击病毒的巨大资产，但我们可以合理地假设，如果出现另一种VOC，它将是对德尔塔变体的改进。因此，随着限制的减轻和资金的收紧，公共卫生实验室将需要寻找节省成本的解决方案，以维持SARS-CoV-2新的和正在出现的变体监测和高通量检测，这一直是它们的防御支柱。

令人闻名于将微流体引入生命科学的美国公司流体，已经推出了其Juno™平台上的“针对SARS-COV-2 Genome”的“有针对性测序测定池”;使用集成流体电路（IFC）的台式系统来自动化分子测试和图书馆准备测序。

该小组将允许公共卫生实验室和疫苗开发商发现新的突变并跟踪传播途径，还将提供重要的SARS-CoV-2进化数据，有助于了解在一个人口或地理区域出现的新毒株。

在对Fluidigm公司EMEA战略营销高级经理Roberto Spada的采访中，他解释了在测序SARS-CoV-2基因组时，通过使用Juno™自动化通常耗时和费力的文库准备步骤，可以节省多少实验室时间。并解释了他们的纳米升样品和分析方法如何在检测SARS-CoV-2和许多其他传染病时节省试剂。

问:Juno™和市场上其他的NGS库准备方法有什么不同?
其中一个主要的区别是，Juno™是唯一可以完全自动化下一代测序库准备过程的台架系统，无论是靶向NGS还是mRNAseq研究。独特之处是它真的可以简化整个过程由于用户只需要加载的化验和样品到我们集成射流电路,或行列(您可以吸管就像经典96/384孔板),然后朱诺照顾所有的休息。这意味着，在为NGS准备库时总是涉及到的所有繁琐的手工步骤，都由“朱诺”号完全自动化了，从而提高了实验室效率和更多可重复的结果。所有这些都是由一种设备完成的，它可以坐在任何实验室的长凳上，而不像某些液体处理机器人那样占用整个房间。

图1所示。使用Juno™及其IFC准备用于测序的ngs准备库的典型工作流程

问：对这样一个高吞吐量的库准备平台的需求在哪里?
我相信需求是存在的，不仅需要高吞吐量的库准备平台，而且需要提供灵活工作流程的平台。

如果我们考虑每日SARS-CoV-2阳性病例的数量在世界范围内,每天仍在数千,需要腾出尽可能多的时间对任何实验室能够执行reflex-testing SARS-CoV-2样本识别变异的担忧。因此，尽管高通量能力很重要，但我们绝不能忘记，大多数检测实验室不仅需要筛查和分析SARS-CoV-2阳性样本，还需要筛查和分析各种不同疾病和条件的患者样本。因此，通过使用相同的工作流程和仪器，有一个平台可以提供测试不同样本的灵活性，可以极大地提高效率和测试周转时间，这在当今世界是至关重要的。

问:为什么实验室要对SARS-CoV-2基因组进行定制化测序?
一旦患者被检测为SARS-CoV-2阳性，标准做法要求对样本再次进行检测，以确定患者感染的是哪种SARS-CoV-2变体。通过执行一个自定义targeted-sequencing SARS-CoV-2基因组面板,提供均匀的覆盖在病毒基因组序列,实验室不仅能保证能够找到已知变异的担忧,但也能够揭示小说变异出现由于SARS-CoV-2已知的高突变率。

问:你能举一个客户在他们的微生物学/病毒学工作中使用这种技术的例子吗?
一个很好的例子是来自我们在法国的一个客户。他们是大学医院分子生物学服务中心的一部分，已经在使用我们的Juno系统对不同肿瘤样本进行靶向NGS筛选。然而，当SARS-CoV-2大流行到来时，他们需要一个简单的解决方案，使他们能够继续对收到的样品进行简单和快速的NGS库准备，而不必完全改变他们习惯的工作流程。通过简单地将我们用于SARS-CoV-2靶向测序的现成分析添加到他们的工作流程中，他们就能够同时进行肿瘤和SARS-CoV-2研究的自动化文库准备，而不需要更换仪器或化学物质，也不需要停机时间。

问：它是什么吞吐量功能？它只适用于高吞吐量实验室吗？
Juno的另一个独特功能是它是一个非常多功能和可扩展的平台。根据实验室的需求，它可用于仅每天每天的样品高达数百个样品。所有这一切都可以在不改变实验室中的化学或工作流程的情况下，因为所有用户都必须在不同尺寸的芯片上加载预先存在的测定，而且它们就准备好了。

问:该技术使用纳米升，而不是分子生物学反应中使用的典型的微升。这是如何实现的呢?
允许客户减少样品和试剂量的主要原因是由于微流体技术在我们的IFCS的核心。通过具有数百个单独的流体电路，该流体电路将不同的样品与不同的测定相结合，所有在一芯片上，我们能够减少执行任何类型的分子测定所需的体积。

问:采用你们的纳米升技术，实验室能省下多少钱?
实际上有很多。没有考虑到的钱实际上可以恢复自动化整个门店库准备过程(当然释放操作时间),我们的国际金融公司技术的使用可以减少成本的2到3倍,花在古典总会在图书馆准备技术。

问:使用纳米升而不是典型的微升，数据质量是否会受到损害或影响?
绝对不是，这实际上是技术的优势之一。实际上是通过小型化测定和通过IFC中存在的固有效益，即客户可以使用令人难以置信的一致和可重复的系统，因为它避免了所有类型的负测定相互作用和交叉污染

问:实验室需要什么仪器来完成这个任务?使用新设备是否需要大量的培训?其中涉及的资本成本是什么?
如前所述，Juno系统是一种台式系统，可以在任何实验室轻松安装和操作。我们的用户由我们的现场应用专家和现场工程师的专家团队培训和帮助，可以在任何时间使用这项技术。

同样重要的是要注意，与通常正在做同样的东西（如液体处理机器人）的其他较大仪器相比，获得仪器的总体所有权总额，但特别是初始资本设备的成本显着降低（如液体处理机器人）。

问:为什么Fluidigm投入如此多的时间和精力将IFCs引入分子生物学实验室?
如上所述，使用能够在纳米液体体积中自动化分子生物学测定的想法来创建IFC。由于IFCS，Fillyigm已经有力，允许其客户能够实现更高的成本效益，规模示例吞吐量，并通过简单地让客户在我们的盘子上装载样品来实现更高的成本效益，规模示例吞吐量和改进时间管理。并且由于我们使用的分析都没有预先发现或固定，这意味着我们的客户可以在他们如何利用我们的技术并使其适应他们的每一切需要方面具有令人难以置信的灵活性。

使用下面提供的按钮请求信息或访问Fluidigm.com了解更多及点击这里观看解释工作流程的现场录音。

传记